重慶國際物流樞紐建設有限責任公司為重慶國際物流樞紐園區唯一運營建設主體，沙坪壩區直管重點國企，統攬園區開發、開放等平臺服務職能，是以國有為引導，以市場為基礎，廣泛涉及倉儲物流、國際貿易、金融結算、城市綜合配套等產業的集團化公司，直接服務40個大型產業項目，已簽約合作企業逾3800家。

公司內設機構8個，分別為綜合管理部（董事會辦公室）、財務投融資部、黨群人事部（宣傳推廣部）、規劃發展部、招商引資部（企業服務部）、建設管理部、口岸物流部、合同法務部（監察審計部）。各部門分別對應其職能職責。

公司立足國際物流樞紐園區口岸、通道、保稅等優勢資源，以物流產業為主導，布局口岸物流、多式聯運、國際貿易、供應鏈金融及大宗商品交易產業，并持續實施港產城景融合戰略，加快醫教娛養和國際社區等城市業態的開發建設。到2030年，公司將建成城市人口50萬、進出口貿易額達1000億、物流體量超全市總量10%的現代化國際物流新城。